کارشناسی: دانشگاه بیرجند، مهندسی کشاورزی زراعت و اصلاح نباتات (86-1382)

کارشناسی ارشد: دانشگاه مازندران، اصلاح نباتات (89-1386)

دکتری: دانشگاه تهران، نانوبیوتکنولوژی (97-1392)

عنوان رساله:  طراحی و ساخت نانوزیست حسگر بمنظور تشخیص ساده و سریع ویروس تریستزا مرکبات

سوابق تدریس:

الف) دروس:

نانوبیوتکنولوژی، موسسه غیر انتفاعی سنا، مقطع کارشناسی ارشد.

آزمایشگاه کاربرد بیوتکنولوژی در اصلاح نباتات ، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، مقطع کارشناسی ارشد.

ب) کارگاه­های آموزشی:

کمیته علمی کارگاه آموزشی تئوری و عملی.Real-Time PCR  پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان ( بهمن 1390)

سوابق اجرایی:

دبیر انجمن علمی زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه بیرجند.

عضو کمیته اجرایی چهاردهمین همایش ملی برنج کشور. پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان.

مسئول راه اندازی گلخانه تحقیقات مولکولی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان.

عضو کمیته نشریات (چاپ و نشر) پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان.

راهنمایی و مشاوره:

• دکتری، کوثر شهسوار میستانی، طراحی روش‌های مبتنی بر نانوساختار  DNAبه منظور تشخیص بیومارکرهای زیستی نظیر  miRNAها در بیماری‌های انسانی، دانشگاه تهران (1397).
• کارشناسی ارشد، آیدا علایی، تشخیص سریع و حساس گلوکز با استفاده از نانوذرات سریم تنگستات به عنوان نانوزیم های تقلیدی دانشگاه تهران (1397).
• کارشناسی ارشد، سارا کبیر نتاج،  بررسی القای ریشه‌های مویین در گیاهان دارویی کاسنی و گل گاوزبان ایرانی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری (1390).
• کارشناسی ارشد، معصومه رضایی مشایی، ارزیابی افتراق بیان ژن‌های کدکننده برخی پروتئین‌های ناقل غشایی در گیاه Aeluropus littoralis در پاسخ به شوری، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری (1390).
• کارشناسی ارشد، مریم میدانسری گاوزن، معرفی و بررسی انتقال‌پذیری نشانگرهای ریزماهواره EST با منشاء گرامینه در گیاه Aeluropus Littoralis ، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری (1391).
• کارشناسی ارشد، الهام یونسی ملردی، اثر شوری بر بیان برخی از ژن‌های موثر بر فرایند فتوسنتزی C4 در گیاه آلوروپوس لیتورالیس، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری (1393).

زمینه های تحقیقاتی:

1. کاربرد نانوفناوری در تشخیص، ردیابی، کنترل و درمان بیماری های ویروسی/ باکتریایی و سرطان
2. طراحی و ساخت نانو زیست حسگرها با هدف تشخیص سریع، درجا و همزمان بیومارکرها  و مولکول های کوچک
3. سنتز سبز و توسعه نانوذرات، نانو مواد، نانوزیم ها و نانو سامانه های هوشمند تقلیدی و جدید بر پایه مولکول های زیستی  
4. کاربرد نانوفناوری و فیزیولوژی مولکولی به منظور افزایش مقاومت گیاهان به آفات نباتی و تنش های محیطی
5. کاربرد نانوفناوری در کشاورزی مولکولی، کشت میکروبی و ریز جلبک ها
6. مطالعات جامع امیکس برهمکنش نانوذرات با سیستم های زنده مدل
7. تحقیق و توسعه (R & D) محصولات فناورانه نانو و کیت های آزمایشگاهی

پروژه های پژوهشی:

1. طراحی و ساخت نانوساختارهای شبه آنزیمی بر پایه DNA با خاصیت اکسیدازی/پراکسیدازی به منظور کاربرد در نانوزیست حسگرها (پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان- مجری طرح، جاری (
2.  ساخت و بررسی نانوکامپوزیت های جذبی/تخریبی آفت کش دیازینون (پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان- مجری طرح، جاری (
3. طراحی و ساخت نانو زیست حسگر به منظور تشخیص ساده و سریع ویروس تریستزای مرکبات. (صندوق حمایت از پژوهشگران و فناوران کشور- همکار طرح، خاتمه یافته)
4. تشکیل پروفایل مولکولی ژرم پلاسم برخی از اکوتیپهای آلوروپوس لیتورالیس و ارزیابی سطح تنوع. (پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان- مجری طرح، خاتمه یافته(
5. ایجاد، حفظ و غربالگری فنوتیپی استوک گیاهی آلوروپوس لیتورالیس به منظور معرفی اکوتیپ های امیدبخش زراعی و پوششی. (پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان- مجری طرح، خاتمه یافته(
6. بررسی جامع تغییرات متابولوم شاخساره گیاه آلوروپوس لیتورالیس در پاسخ به شوری. (پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان- همکار طرح، خاتمه یافته(
7. جداسازی  SSRهای ژنومی و توسعه EST-SSR ها در هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس. (پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان- همکار طرح، خاتمه یافته(
8. بررسی جامع تغییرات متابولوم و پروتئوم گیاه آلوروپوس لیتورالیس در پاسخ به شوری. (پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان- همکار طرح، خاتمه یافته(

• Shokri, E., Hosseini, M., Sadeghan, A.A., Bahmani, A., Nasiri, N. and Hosseinkhani, S., 2020. Virus-directed synthesis of emitting copper nanoclusters as an approach to simple tracer preparation for the detection of Citrus Tristeza Virus through the fluorescence anisotropy immunoassay. Sensors and Actuators B: Chemical, p.128634.
• Shahsavar, K., Shokri, E. Hosseini, M., 2020. A fluorescence-readout Method for miRNA-155 detection with double-hairpin molecular beacon based on quadruplex DNA structure. Microchemical Journal, p.105277.
• Shamasbi, F.V., Nasiri, N. and Shokri, E., 2018. Genetic Diversity of Persian Ecotypes of Indian Walnut (Aeluropus littoralis (Gouan) Pari.) by AFLP and ISSR Markers. Cytology and Genetics, 52(3), pp.222-230.
• Shokri, E., Hosseini, M., Davari, M.D., Ganjali, M.R., Peppelenbosch, M.P. and Rezaee, F., 2017. Disulfideinduced self-assembled targets: A novel strategy for the label free colorimetric detection of DNAs/RNAs via unmodified gold nanoparticles. Scientific Reports, 7, p.45837.
•  Shahsavar, K., Hosseini, M., Shokri, E., Ganjali, M.R. and Ju, H., 2017. A sensitive colorimetric aptasensor with a triple-helix molecular switch based on peroxidase-like activity of a DNAzyme for ATP detection. Analytical Methods, 9(32), pp.4726-4731.
• Hosseini, M., Khaki, F., Shokri, E., Khabbaz, H., Dadmehr, M., Ganjali, M.R., Feizabadi, M. and Ajloo, D., 2017. Study on the Interaction of the CpG Alternating DNA with CdTe Quantum Dots. Journal of fluorescence, 27(6), pp.2059-2068.
• Shokri, E., Hosseini, M., Faridbod, F. and Rahaie, M., 2016. Rapid pre-symptomatic recognition of tristeza viral RNA by a novel fluorescent self-dimerized DNA–silver nanocluster probe. RSC Advances, 6(101), pp.99437-99443.
• Shokri, E., Hosseini, M., Faridbod, F. and Rahaie, M., 2016. Synthesis and Assessment of DNA/Silver Nanoclusters Probes for Optimal and Selective Detection of Tristeza Virus Mild Strains. Journal of fluorescence, 26(5), pp.1795-1803.
• Shokri, E., Nematzadeh, G., Zolala, J., Nasiri, N., Kazemi-Tabar, S.K. and Hosseinpour-Azad, N., 2012. Delta6 desaturase makes a different fatty acid profile of seed oil in Iranian borage (Echium amoenum Fisch. and Mey.). Acta physiologiae plantarum, 34(6), pp.2413-2418.
•  Nasiri, N., Shokri, E., and Nematzadeh, Gh., 2012. Aeluropus littoralis NaCl-induced vacuolar H+ -ATPase subunit c molecular cloning and different expression analysis. Russian Journal of Genetics.
•  Nasiri N., Shokri, E., and Nematzadeh, Gh., 2012. Salt-induced reduction in shoot spermine pool of Aeluropus littoralis. Advances in Environmental Biology, pp.1765-1769.
•  Nasiri, N., Shokri, E., and Nematzadeh, Gh., 2012. Assessment of Na+ /H+ antiporters and H+ -ATpase pumps transcriptional changes in Aeluropus littoralis dealing with salt stress. Advances in Environmental Biology, pp.1769-1774.

مقالات علمی-پژوهشی داخلی

• الهام یونسی ملردی، قربانعلی نعمت­زاده،  احسان شکری. ارزیابی فیزیولوژیک، جداسازی، بررسی بیو انفورماتیک و بیان ژن NADP- مالیک آنزیم تحت تنش شوری در آلوروپوس لیتورالیس. ژنتیک نوین. دوره 12، شماره 32، پائیز 1396، صفحه 476-463.
• الهام یونسی ملردی، قربانعلی نعمت­زاده،  احسان شکری. جداسازی و بررسی بیان ایزوفرم فتوسنتزی ژن فسفوانول پیروات کربوکسیلاز در گیاه شورزیست آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری. پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی. دوره 9، شماره 24، زمستان 1396، صفحه 78-69.
• مریم میدانسری، قربانعلی نعمت­زاده، نجمه نصیری، احسان شکری. بررسی تنوع ژنتیکی گیاه چمن­شور ساحلی (Aeluropus littoralis) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره انتقال­پذیر مبتنی بر EST. پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی. سال 9، شماره22، تابستان 1396، صفحه 30-23.
• مریم میدانسری، قربانعلی نعمت­زاده، احسان شکری. کاوش کتابخانه­های شوری (EST) آلوروپوس لیتورالیس به منظور شناسایی نشانگرهای ریزماهواره. ژنتیک نوین. دوره 10، شماره 4، زمستان 1394، صفحه 566-557.
• احسان شکری، نجمه نصیری، قربانعلی نعمت­زاده. همسانه سازی مولکولی ترادف رمزکننده ژن H⁺- ATPase غشای پلاسمایی در گراس شورزی Aeluropus littoralis.. مجله پژوهش­های سلولی و ملکولی (مجله زیست شناسی ایران). دوره 27، شماره 3، پائیز 1393، صفحه 388-377.
• معصومه رضایی­مشایی، قربانعلی ­نعمت­زاده، حسین عسکری، احسان شکری. ارزیابی فیزیولوژیک رفتار هالوفیت Aeluropus littoralis در واکنش به شوری. تحقیقات مرتع و بیابان ایران. دوره 21، شماره 1، بهار 1393، صفحه 164-154.        
• Younesi-Melerdi., E, Nematzadeh., Gh, Shokri., E. 2014. Codon bias patterns in photosynthetic genes of halophytic grass Aeluropus littoralis. Journal of Plant Molecular Breeding (JPMB), 2(1):12-20. 
• سارا کبیر نتاج، قربانعلی نعمت­زاده، جعفرذوالعلی، احسان شکری. بهینه­سازی شرایط القاء و تثبیت کشت ریشه­های مویین گیاه کاسنی حاصل از تلقیح اگروباکتریوم رایزوژنز. مجله علمی- پژوهشی بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره 4، شماره 2، پائیز و زمستان 1391، صفحه 75-61.     
• نجمه نصیری، قربانعلی نعمت­زاده، حسین عسکری، احسان شکری. مطالعه پاسخ پروتئوم برگ گیاه Aeluropus littoralis در شرایط تنش شوری. مجله علمی-پژوهشی تازه های بیوتکنولوژی سلولی و مولکولی. جلد 2، شماره 8، زمستان 1391، صفحه 35-27.
• نورالدین حسین­پور آزاد، قربانعلی نعمت­زاده، محمد آزادبخت، سیدکمال کاظمی­تبار، احسان شکری. بررسی تنوع اسید چرب گامالینولنیک اسید (امگا 6) در اندام­های 16 اکوتیپ از گل­گاوزبان ایرانی با روش TLC. مجله علمی-پژوهشی گیاه و زیست بوم. دوره 5، شماره 32،  پائیز 1391، صفحه 124-115.
• احسان شکری، سیدکمال کاطمی­تبار،جعفر دوالعلی، قربانعلی نعمت­زاده، نورالدین حسین­پورآزاد، نجمه نصیری. همسانه سازی و تعیین خصوصیات ژن دلتا سیکس دسچوراز (d6d)، از گیاه گل گاو زبان ایرانی(Echium amoenum) . دوفصلنامه علمی-پژوهشی تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران. جلد 19، شماره 2، 1390، صفحه 217-205.  (ISC)
• نجمه نصیری، احسان شکری ، قربانعلی نعمت­زاده. همسانه­سازی و تعیین خصوصیات ژن زیر واحد c آنزیم H⁺-ATPase واکوئلی در گیاه هالوفیتAeluropus littoralis.. مجله علمی-پژوهشی تازه های بیوتکنولوژی سلولی و مولکولی. جلد 2، شماره 5، زمستان 1390، صفحه 23-15.
• نجمه نصیری، قربانعلی نعمت­زاده، احسان شکری شناسایی ماده آلوجیبریک اسید در پوشینه گیاه Aeluropus littoralis و تأثیر آن بر روی جوانه­زنی در سطوح مختلف شوری. مجله علمی-پژوهشی مرتع. سال پنجم، شماره دوم، تابستان 1390، صفحه 228-219. (ISC)
• محمد آزادبخت، قربانعلی نعمت­زاده، نورالدین حسین­پور­آزاد، احسان شکری. بررسی کمی و کیفی آلکالوئیدهای پیرولیزیدینی در اندام­های ریشه، برگ، گلبرگ­ها و بذور گیاه دارویی گاوزبان ایرانی. مجله دانشگاه علوم­پزشکی مازندران. جلد 1، شماره 21، اسفند 1390، صفحه 137-131. (ISC)
• نورالدین حسین­پور آزاد، قربانعلی نعمت­زاده، محمد آزادبخت، سیدکمال کاظمی­تبار، احسان شکری. بررسی اسیدهای چرب بذر گل گاوزبان ایرانی(E.amoenum) در دو اکوتیپ مختلف. فصلنامه علمی-پژوهشی تحقیقات گیاهان دارویی و معطر ایران. جلد 27، شماره 4، صفحه 595-587، 1390. (ISC)
• نورالدین حسین­پور آزاد، قربانعلی نعمت­زاده، محمد آزادبخت، سیدکمال کاظمی­تبار، احسان شکری بررسی تنوع ژنتیکی برخی از اکوتیپ­های گل گاوزبان ایرانی (Echium amoenum) نواحی شمال و غرب ایران با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD. دوفصلنامه علمی-پژوهشی تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران، جلد 19، شماره 1، صفحه 12-1، 1390.  (ISC)

گزیده مقالات کنگره و همایش­های داخلی و خارجی:

•  الهام یونسی ملردی، قربانعلی نعمت­زاده،  احسان شکری. بررسی الگوی تمایل کدونی ژن­های فتوسنتزی در گیاه شورزی آلوروپوس لیتورالیس. اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران. 3 الی 5 خرداد 1393، تهران، ایران. (سخنرانی)
• مریم میدانسری، قربانعلی نعمت­زاده، احسان شکری، حشمت­ا.. رحیمیان. معرفی و ارزیابی تکثیر نشانگرهای EST-SSR در گیاه آلوروپوس لیتورالیس. دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران، 3-1 خرداد­ماه 1391، تهران، ایران. (سخنرانی)
• سارا کبیر نتاج، قربانعلی نعمت­زاده، احسان شکری، حامد صالحیان آقبلاغ. بررسی کالوس­دهی و باززایی غیر مستقیم در گیاه گل­گاوزبان ایرانی(Echium amoenum Fisch. And C.A. Mey). هفتمین همایش ملی بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران. 21 الی 23 شهریورماه 1390، تهران، ایران. (سخنرانی)
• حسین عسکری، سیدحمیدرضا هاشمی­پطرودی، قربانعلی نعمت­زاده، عباس سعیدی، مریم خلیفه سلطانی، زهره طاهری، احسان صادق­نژاد، نجمه نصیری، احسان شکری، سارا حمزه­لو، میلاد احمدی. هالوفیتیسم گیاهان زراعی. هفتمین همایش ملی بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران. 21 الی 23 شهریورماه 1390، تهران، ایران (سخنرانی کلیدی).

جوایز و افتخارات:

1. رتبه 1 مجموع آزمون کتبی و مصاحبه علمی دکتری نانوبیوتکنولوژی در دانشگاه های پذیرنده (دانشگاه تهران، تربیت مدرس، صنعتی اصفهان، شهرکرد)، 1392
2. محصول برگزیده (رتبه سوم) در نخستین رویداد ملی طراحی و ساخت نانوحسگرهای زیستی تشخیص سریع با عنوان کیت تشخیص ساده و ارزان ویروئیدها و ویروس های گیاهی بر پایه نانورنگ سنجی، 1397
3.  طرح پژوهشی برگزیده با عنوان "ساخت نانوزیست حسگر به منظور تشخیص ساده و سریع و ارزان ویروس تریستزا" در برنامه شکوفایی و مسابقه دستاوردهای پارک علم و فناوری دانشگاه تهران،
4. رساله دکتری برگزیده در برنامه نانو مچ ستاد نانوفناوری و دهمین نمایشگاه فناوری نانو، 1396

ثبت ژن، ژنوم و میکروارگانیزم:

1. GU237486 (delta-6 desaturase (d6d) enzyme)
2. JF504672 (vacuolar H+-ATPase 16 kDa proteolipid subunit c (VATPc)),
3. JN601138 (plasma membrane H+-ATPase),
4. KP122942 (NADP-dependent malic enzyme),
5. KP122943 (D-glycerate 3-kinase),
6. KP122944 (pyruvate orthophosphate dikinase),
7. KP122945 (phosphoenolpyruvate carboxylase),
8. MF433044 (small subunit ribosomal RNA gene),
9. MF433045 (cytochrome c oxidase subunit I gen (COX1)),
10. MF433046 (gigantean (GI)).